محققان روسی، فن آوری جدیدی ابداع کرده اند که نشان می دهد آران ای چطور فعالیت ژن ها را تنظیم می کند.
به گزارش ایسنا و به نقل از فیز، کشف شمار زيادي از آران آی های موسوم به "lncRNA" در ژنوم پستانداران، موضوع شگفت آوری در پژوهش های اخیر حوزه ژنوم است که در مقیاس بزرگ انجام شده اند.
محققان"آکادمی علوم روسیه" (RAS) و"مؤسسه فیزیک و فناوری مسکو" (MIPT)، روش قابل اطمینانی برای ارزیابی نقش lncRNAها ابداع کرده اند. این روش جدید و داده های حاصل شده با کمک آن، امکان ارائه فرضیات مهمی را در خصوص عملکردهای خاص lncRNAها فراهم می کنند.
این روش جدید موسوم به "RADICL- seq" میتواند به نقشه برداری جامع از هر آران آی بپردازد که هنگام تعامل با نواحی ژنوم مورد بررسی قرار می گیرند.
آران آی و تنظیم ژن
هرچند تعداد آران ای های کدگذاری نشده و آن دسته از آران ای ها که پروتئین (Protein) ها را کدگذاری می کنند، تقریباً شبیه است ولی عملکرد بیشتر آران ای های کدگذاری نشده هنوز کاملاً معلوم نیست.
هر نوع سلول، مجموعه ژن های فعال خود را دارد که به تولید پروتئینهای خاصی منجر می شوند. همین مسئله باعث می شود که سلول مغز با سلول خون یک ارگانیسم مشابه، متفاوت باشد. دانشمندان اینک در حال رسیدن به این نتیجه هستند که آران ای، یکی از عواملی است که تعیین می کند کدام ژن ها بیان شوند یا فعالیت کنند.
lncRNAها با رشته های نازک و نامنظمی در هسته سلول در تعامل هستند که با اسم "کروماتین" (chromatin) شناخته می شوند. کروماتین این توانایی را دارد که ترکیب یا شکل خود را تغییر دهد؛ در نتیجه ژن های خاص یا رونویسی و یا پنهان می شوند. lncRNAها به واسطه تعامل با نواحی خاصی از کروماتین، در تغییر ترکیب و فعالیت ژن نقش دارند. آگاهی در خصوص ناحیه ای از کروماتین که آران ای با آن در ارتباط است، موضوع مهمی برای درک قابلیت تنظیم آران ای به شمار می رود.
نحوه کارکرد روش جدید
آران ای ها با اتصال به پروتئینهای وابسته به کروماتین، با کروماتین داخل هسته سلول تعامل برقرار می کنند. اکنون، چندین فن آوری وجود دارند که میتوانند از تعامل میان آران ای و کروماتین نقشه برداری کنند ولی با محدودیت های چشمگیری همراه هستند.
محققان برای برطرف کردن این محدودیت ها، روش RADICL- seq را ارائه دادند. این روش میتواند نتیجه دقیق تری ارائه دهد و سلول ها را تا هنگامی که ارتباط میان آران ای و کروماتین قطع نشده است، سالم نگه می دارد.
بررسی ها نشان داد تعامل های میان آران ای و کروماتین که با روش RADICL- seq نقشه برداری شده اند، دقت بالاتری نسبت به نقشه برداری با روش های کنونی دارند.
این پژوهش، در مجله "Nature Communications" به چاپ رسید.
- 19
- 6
